生体情報科学	形態形成機構学	機能微細形態学
細胞機能制御学	遺伝薬理学	腫瘍生物学
病態生物医学	病理診断学	微生物感染症学
免疫細胞生物学	法医学	医化学
分子細胞情報学	分子腫瘍学	分子遺伝学
放射線遺伝学	高次脳形態学	認知行動脳科学
神経生物学	神経・細胞薬理学	公衆衛生学
実験動物学	先天異常学(先天異常標本解析センター)
疾患ゲノム疫学	ゲノム情報科学	医学教育学
免疫ゲノム医学(寄附講座)	統計遺伝学

法精神医学	血液・腫瘍内科学	内分泌・代謝内科学
循環器内科学	消化器内科学	呼吸器内科学
臨床免疫学	加齢医学	糖尿病・栄養内科学
初期診療・救急医学	腎臓内科学	皮膚科学
発達小児科学	放射線腫瘍学・画像応用治療学
画像診断学・核医学	臨床病態検査学	消化管外科学
肝胆膵・移植外科学	乳腺外科学	麻酔科学
婦人科学・産科学	泌尿器科学	心臓血管外科学
呼吸器外科学	形成外科学	眼科学
耳鼻咽喉科・頭頸部外科学		整形外科学
口腔外科学	分子病診療学	臨床神経学
脳神経外科学	精神医学	輸血医学
病理診断学	医療情報学	薬剤学
探索医療開発学	臨床試験管理学	臨床創成医学
臨床脳生理学	脳機能イメージング
集学的がん診療学（寄付講座）		呼吸管理睡眠制御学（寄付講座）
探索臨床腫瘍学（寄付講座）		リウマチ性疾患制御学（寄付講座）
臨床腫瘍薬理学（寄付講座）		標的治療腫瘍学(寄付講座)

レプチン・脂肪細胞プロジェクト	血管新生・組織再生プロジェクト
抗ＰＤ-1免疫療法プロジェクト	食道癌ＰＤＴプロジェクト
膵β細胞イメージングプロジェクト

医療疫学	薬剤疫学	医療経済学
医療倫理学	環境衛生学	社会疫学
健康情報学	健康増進・行動学

放射線システム生物学研究部門（ゲノム維持機構研究）

突然変異機構研究部門クロマチン制御ネットワーク研究分野

晩発効果研究部門（ＤＮＡ損傷シグナル研究）

ゲノム動態研究部門（ゲノム動態研究）

ケミカルバイオロジー

細胞機能調節学	生体微細構造学	生体機能調節学
生体システム制御学	生体分子設計学	発生分化研究
再生増殖制御学	再生免疫学	器官形成応用
臓器再建応用	ナノバイオプロセス研究領域	シミュレーション医工学
組織再生応用	バイオメカニクス研究領域

腫瘍ウイルス生物学	発がん分子機構学	ウイルス病態学
分子腫瘍ウイルス学	免疫細胞学	感染防御生物学
細胞生物学	感染病態学	ウイルス感染症学

粒子線腫瘍学

病原細菌学

フィールド医学

初期化機構研究部門

増殖分化機構研究部門

臨床応用研究部門

予防医療学

発生生物学

応用発生生物学（理化学研究所）

生殖細胞工学（理化学研究所）

分子発生学（大阪バイオサイエンス研究所）

再生応用生物学(理化学研究所）

ヒト化マウス研究（理化学研究所）

神経病態科学（理化学研究所）